Ambas, dependiendo del contexto. Si tengo como acceder directo al equipo en cuestión (desde la app de vm correspondiente o en físico al equipo) uso la línea de comandos propia de Linux. En casos especiales, donde la administración de la vm me exige pegar comandos desde un origen externo, uso putty, igual cuando no tengo acceso directo al equipo. Use un par de veces MobaXterm, pero no me gustó su interfaz, además que para pegar comandos es más lento, en putty clic derecho yera.
Para administrar switches y routers prefiero ssh por putty a usar telnet. Cuando es por cable consola, putty es LA opción, ya que las otras opciones para iniciar la conexión son más basura y más complicadas.
El cliente ssh de windows... Parecido a openssh, así que le he dado oportunidad un par de veces, pero desde Powershell, porque desde cmd es una basura.
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