Si, el objetivo del humanoide es básicamente ir y conectarse a la mente colmena de la torre. El juego da a entender que las maquinas están ahí porque la civilización que creó todo ya tenia que lidiar contra el parasito y dejó todo eso ahí para ayudarnos en caso de que se nos pegue, por eso existen maquinarias que lo extirpan y que eliminan sus resultados (ramificaciones). El juego básicamente es sobre la vida (nacimiento, reproducción y muerte). El parasito hace literal como una relaciona toxica por lo que entendí; te da armas y elementos para curarte pero a la vez te empieza a matar de a poco, al final termina por consumirte como lo haría una relación toxica de ese tipo.
Lo curioso es que todo lo que haces en el juego tiene relación a la tortura (te acuchillan, te clavan una llave, te clavan el brazo, etc) donde básicamente eres una herramienta que tiene como fin reproducirse, quizás por eso el nombre del juego. La trama la encuentro muy similar a Prometeo también.
Lo único que no entendí bien fue el tema cuando peleas con los homúnculos, cuando los conectas a unos robots y se revelan. Pueden simbolizar cualquier cosa. (embarazos no deseados, desesperación por aferrarse a la vida), etc.