Como dice el socio de arriba, registra tu producto, te evitas mil problemas.
Ahora, piensa que invertiste tiempo, ideas, mano de obra, no puedes cobrar poco, tambien considera que el estado, por mas dinero que te pague, te va a pagar una sola vez, y se va a ahorrar 300 millones, y definitivamente yo creo q el estado no te va a pagar tamaña cantidad.
Te aconsejo, analices el tema con alguien de confianza que tenga conocimientos en cuanto a negocios, y que te guie para tener una solución que te permita ganar plata y no perder tanto (considera la opcion de entregarle a dicha institución, una version básica de tu programa, asi vas creando plugins y extensiones, para sacar un extra en $$).
Eso, mas no puedo ayudar, porque en temas de dinero es dificil hablar.
Suerte en todo.
Saludos