Pide prórroga, creo que hay dos artículos que te lo permiten:
Esto podrías aplicarlo en el momento que tuviste dificultades, te suspenderían la beca, pero podrías tomar un tiempo para solucionar algunas cosas y ordenar tu vida o tu investigación.
Por lo que entiendo, ya pasaron los 2 años, así que podrías aplicar:
SI estás complicada con conseguir apoyo del Jefe de Programa, y ves que está imposibru cumplir ... acércate donde corresponda para negociar un Convenio de Pago - número de cuotas, valor, intereses - generalmente lo tienen estipulado, espera lo que te ofrecen ... si estás en una muy mala situación, llora carta no más, expresando que quieres pagar pero en "estas condiciones" y presentas una propuesta, si no te la aceptan y lo que te proponen es muy abusivo, buscaría otras formas más "cómodas" para pagar esa deuda.
Edit: si hubieses llegado un mes antes, te diría - aún quizá sirve todavía - que si estás en ingeniería y tu tesis aplica para desarrollar una tecnología comercialmente viable, hay concursos que te la financien. En el VIU, la postulación terminó el 23 abril, te daban un poco más de 30 palitos.
O tírate a un Corfo, semilla, o Sercotec, lucas hay, y si eres mujer e ingeniera, hay prioridad, solo hay que saber venderla