Hermanito, siempre y cuando el .FLAC sea rippeado de un disco de primera edición será MIL VECES mejor que de un remaster o algo parecido, mi biblioteca entera está en formato .m4a (.FLAC de Apple), y la diferencia es ABISMAL entre un .MP3 a 320kbps, tiene mayor rango de frecuencias (mayor cantidad de información), es más, con unos buenos fonos entry-level (Beyerdynamic Byron, buenos bonitos y baratos a $45,000.- en mediaplayer.cl) aprovecha al máximo ese tipo de archivo, aunque le recomiendo que si tiene música en .FLAC, escúchela en un teléfono con Android y descargue Onkyo Player, el mejor reproductor de .FLACs para Android y teléfonos en general.
Un ejemplo de lo que digo es una risa que se escucha al principio de la canción "África" de Toto, con un .MP3 a 320kbps o video de youtube no se nota ni escucha, pero en .FLAC con los fonos que puse ahí se escucha super clarita.