Ojo con pensar que ISIS y Talibanes son lo mismos, o peor incluso que son aliados. Desde el 2015 ambos bandos están en un conflicto armado, es mas hace poco los Talibanes ejecutaron a varios presos de ISIS.
Que ambos sean extremistas relacionados a la religion del Islam no significa que sean de ambos bandos.
Es cierto, existen muchas diferencias, empezando quizás por la más importante la cual es que el Estado Islámico proclama un "califato" (un territorio islámico en constante expansión), en cambio los talibanes proclaman un "emirato islámico", que es un Estado islámico en un territorio determinado.
También, es necesario hacer la acotación que en Afganistán los muyahedines afganos, fueron aquellos que lucharon en contra de los soviéticos, y no necesariamente eran afines a la ideología talibán. En efecto, en la guerra civil afgana (1992-1996), se podría decir que varios grupos de muyahedines se enfrentaron entre sí triunfando finalmente el de los talibanes, debido en gran parte al apoyo de la población, ya que los talibanes traían orden, a diferencia de los señores de la guerra muyahedines los cuales muchos de ellos eran corruptos y tiránicos.
Posteriormente, una vez que el gobierno talibán alcanza el poder (año 1996) se forma la Alianza del Norte o el Frente Islámico de Afganistán, liderado por Ahmad Shah Masud, y que fue uno de los principales grupos armados que combatieron a los talibanes. La Alianza del Norte estaba conformada principalmente por etnias del Norte de Afganistán, como los tayikos, siendo que la mayoría de los talibanes lo integraban pashtunes (por lo que este conflicto tenía grandes ribetes étnicos también).
Los talibanes por su parte, tienen varias particularidades que los distingue de otros grupos fundamentalistas como el Estado Islámico. El movimiento talibán, nace en Pakistán, en campos de refugiados de afganos durante la guerra contra la URSS. En las escuelas islámicas de esos campos de refugiados se empezó a enseñar una visión particular del islam, es más, talibán en idioma pashtun significa "estudiantes", ya que los talibanes surgen de las escuelas islámicas.
La proliferación de las escuelas islámicas surgieron por influencia de las madrasas Deobandis, movimiento fundamentalista proveniente de la parte musulmana de la India. Si el otrora líder de los talibanes (Mohammad Omar) estudio precisamente en una escuela deobandi de Kandahar.
Entonces, le sumamos una base intelectual religiosa propia proveniente de musulmanes de la India, y por otro lado, también le sumamos costumbres tribales propias del pueblo pashtun, lo que da como resultado al movimiento talibán que todos conocemos y que tiene características bien particulares muy distintas a las del Estado Islámico y otros grupos islámicos fundamentalistas.
En síntesis, el movimiento talibán surge como consecuencia de la invasión soviética, en donde ciertos clérigos de la escuela deobandis aprovechan el caos generado por la guerra para impartir sus enseñanzas a los afganos desesperanzados que estaban en Pakistán.... y si nos vamos aún más al pasado, el movimiento islámico deobandis surgió como reacción a la colonización de los británicos en la India en 1867.