Les traigo la ultima información de la caracterización 3D del ARN viral del Sars-cov2, esto fue logrado gracias el equipo que dirige la Dra Yununiz Suarez Maiza de la Universidad de Carabobo, quien ha podido caracterizar el material genético viral.
El ARN del coronavirus humano SARS-CoV-2 codifica la poliproteína ORF1b que se escinde en varias proteínas relevantes en su replicación. Una de ellas es la
polimerasa de ARN dependiente de ARN, llamada RdRp, o nsp12, clave en la catálisis de la síntesis del ARN del virus y diana de fármacos antivirales como
remdesivir y
sofosbuvir. Se acaba de publicar en bioRxiv la estructura tridimensional del complejo proteico nsp12-nsp7-nsp8; se ha obtenido por criomicroscopia electrónica (cryo-EM) con una resolución de 2.9 Å. Además de ayudar a entender cómo actúan
remdesivir y
sofosbuvir, se espera que permita desarrollar nuevos antivirales específicos contra COVID-19 que sean más eficaces.
La estructura 3D del complejo proteico nsp12-nsp7-nsp8 del coronavirus humano SARS-CoV se publicó en
Nature Communications en 2019. Comparte muchas semejanzas (estructuras conservadas) con la de SARS-CoV-2 (antes llamado 2019-nCoV). Pero las pocas diferencias son claves para el desarrollo de antivirales específicos contra COVID-19. Esta figura muestra las diferencias entre las secuencias de aminoácidos de la proteína nsp12 del nuevo coronavirus humano SARS-CoV-2 (2019-nCoV en la figura), el coronavirus humano SARS-CoV y el coronavirus de murciélagos RaTG13. Parecen pocas diferencias, pero son suficientes para que los antivirales más eficaces contra SARS no sean los más eficaces contra COVID-19.
La estructura tridimensional a escala atómica de la proteína nsp12 permite estudiar con todo lujo de detalles su interacción con antivirales. En esta figura se muestra las interacciones propuestas para
remdesivir y sofosbuvir. Supongo que ya sabrás que tres hospitales españoles han iniciado ensayos con remdesivir contra el Covid-19 (Marta Riesgo, “España inicia ensayos con remdesivir para tratar el Covid-19. Remdesivir, de Gilead, se estudiará en pacientes con coronavirus en hospitales de País Vasco, Madrid y Barcelona”,
Gaceta Médica, 15 mar 2020). Todos esperamos que sean exitosos, como sugieron dos estudios previos, uno
in vitro en China y otro
in vivo con el primer paciente de Washington
No soy experto en estas áreas, así que no entraré en una discusión detallada de las diferencias entre las estructuras 3D de la polimerasa de ARN nsp12 de SARS-CoV y SARS-CoV-2. Los lectores interesados en dichos residuos pueden consultar el artículo en bioRxiv. Solo quiero resaltar que nsp12 es una diana excelente para el desarrollo de nuevas terapias antivirales. Ya se conocen varios fármacos que la inhiben que podrían formar parte de los cócteles antivirales que se acaben usando en la práctica clínica. Hay quien duda de que se logre una vacuna (que como muy pronto llegará a finales de 2020), pero lo que está claro es que mucho antes habrá tratamientos eficaces con antivirales, la gran esperanza para los infectados.
